Macintosh

情報系は Macintosh を利用する人が多い。バイオインフォマティクスの分野では長時間かかる処理は Linux を利用するが、プログラムを作ったり、プログラムのテストを行ったりする場合は Macintosh が比較的に利用されている。Macintosh は操作性が良い上に、作成したプログラムをすぐに実行できるというメリットがある。バイオインフォマティクスの初心者にとっては Macintosh がおすすめ。

Homebrew Mac のパッケージ管理ソフトウェア。brew を利用することで様々なアプリケーションを簡単にインストールできるようになる。
Xcode Mac 関連のアプリケーション開発を行う際に必須なプログラムライブラリーと開発環境がセットになったソフトウェアである。開発中のプログラムや非公式 Mac アプリケーションなどを利用する際に Xcode がないと不便であるため、開発者でなくてもぜひインストールしておきたい。App Store から簡単にインストールできる。
iTerm コマンドを実行できる環境として、Mac に標準搭載された端末(ターミナル)がある。しかし、端末の機能が少なく、少し扱いづらいというデリメットがあり。iTerm は Mac の端末の代わりとして使われている、高機能なコマンド実行環境である。
blast 塩基配列またはアミノ酸配列のホモロジー検索プログラム。
R 統計の分野でよく利用されている。生物統計に特化した様々なパッケージなどが提供され、しっかりメンテナンスされていて、半年ごとにアップデートされている。
VirtualBox VirtualBox とその拡張パッケージのインストール方法。